北京時(shí)間2022年2月16日，國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)刊物Cell在線發(fā)表了南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院/前沿交叉研究院聯(lián)合中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院以及軍事獸醫(yī)研究所等國(guó)內(nèi)外單位完成的研究論文：“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”。論文共同通訊作者為我校粟碩教授（Lead contact）、中山大學(xué)施莽教授、悉尼大學(xué)愛(ài)德華·霍爾姆斯教授。我校博士研究生何婉婷、中山大學(xué)博士研究生侯新、我校碩士研究生趙晉為論文共同第一作者。這是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)首次以第一通訊作者單位在CELL發(fā)表研究成果，也是我國(guó)動(dòng)物傳染病防控領(lǐng)域的突破性研究進(jìn)展。

據(jù)統(tǒng)計(jì)，70%以上的人類(lèi)傳染病病原來(lái)自動(dòng)物。因此，研究與人類(lèi)或者家畜可能密切接觸的野生動(dòng)物病毒攜帶情況與多樣性，對(duì)人類(lèi)和家畜新發(fā)傳染病的防控至關(guān)重要。該論文對(duì)來(lái)自中國(guó)20個(gè)省份18個(gè)物種共1941只哺乳動(dòng)物的樣本展開(kāi)了系統(tǒng)的病毒轉(zhuǎn)錄組研究，發(fā)現(xiàn)13個(gè)病毒科中的102種病毒可以感染哺乳動(dòng)物（圖1），其中65種病毒為首次發(fā)現(xiàn)存在于哺乳動(dòng)物中，例如：海貍鼠輪狀病毒（Coypu rotavirus）、穿山甲瘟病毒（Pangolin pestivirus）、竹鼠札幌病毒（Bamboo rat sapovirus）等。該研究極大的拓展了對(duì)多種野生動(dòng)物攜帶病毒多樣性的認(rèn)識(shí)，為人類(lèi)和家畜疫病預(yù)警和防控提供了重要科學(xué)依據(jù)。

圖1：野生動(dòng)物中攜帶的與脊椎動(dòng)物相關(guān)的病毒

在本研究中報(bào)道了豪豬丁型冠狀病毒（Deltacoronavirus HKU17），牛副流感病毒3型（Bovine parainfluenza virus 3）、哺乳動(dòng)物正腮腺炎病毒5型（Mammalian orthorubulavirus 5）、H9N2亞型流感病毒(Influenza A virus H9N2)等21種對(duì)人類(lèi)和家畜具有潛在高傳播風(fēng)險(xiǎn)的病毒。發(fā)現(xiàn)貉、果子貍、竹鼠、豪豬、刺猬等多種野生動(dòng)物可攜帶冠狀病毒，其中腹瀉的貉樣本中攜帶的四株新型犬冠狀病毒（Canine coronavirus，CCoV）與最新報(bào)道的可導(dǎo)致人類(lèi)疾病的重組CCoV毒株CCoV-HuPn-2018的基因同源性達(dá)93.65%-94.27%；基于病毒刺突蛋白（Spike protein, S）中的非重組區(qū)域分析發(fā)現(xiàn)四株新的貉CCoV形成了一個(gè)單獨(dú)的譜系（圖2）。因此，這種冠狀病毒的跨物種傳播風(fēng)險(xiǎn)值得關(guān)注。本研究還發(fā)現(xiàn)了多種高豐度的輪狀病毒(Rotavirus)，包括A、B、C、D和I群。兔、貉、豪豬和海貍鼠等動(dòng)物均攜帶輪狀病毒A群。同時(shí)高豐度的輪狀A(yù)群、C群和I群的共感染在腹瀉的貉中發(fā)現(xiàn)，提示輪狀病毒存在跨物種傳播和公共衛(wèi)生風(fēng)險(xiǎn)。

圖2：貉CCoV的基因組重組與進(jìn)化分析

盡管這些野生動(dòng)物不一定是這些高風(fēng)險(xiǎn)病毒的存儲(chǔ)宿主（圖3），但可能會(huì)作為中間宿主通過(guò)跨物種傳播，把病原體傳播給人類(lèi)和家畜。該研究結(jié)果還表明，一些看似健康的動(dòng)物身上也可以攜帶和人類(lèi)致病密切相關(guān)的病毒，并且在不同物種之間持續(xù)傳播。這再次凸顯了交易、食用以及密切接觸野味動(dòng)物的風(fēng)險(xiǎn)，揭示野生動(dòng)物作為疾病出現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)因素的重要性。同時(shí)，研究結(jié)果可為新發(fā)傳染病防控關(guān)口前移等重大疫病防控政策制定提供新的思路。

圖3：野生動(dòng)物攜帶潛在人畜共患病病毒與宿主之間的關(guān)聯(lián)分析

本研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)青基金（31922081）等項(xiàng)目支持資助，同時(shí)貉冠狀病毒流行病學(xué)研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目課題“畜禽冠狀病毒的流行傳播特征與遺傳演化規(guī)律（2021YFD1801101）”支持資助。

論文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422001945